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大腸鏡檢查換能器將肌肉骨骼超音波脈衝發送到組織中，然後接收迴聲。回波包含空間和對比度信息。該概念類似於在航海應用中使用的聲納，但是醫學肌肉骨骼超音波中的技術更為複雜，可以收集足夠的數據以形成快速移動的二維灰度圖像。

大腸鏡檢查優點

大腸鏡超音波波使用非電離聲波，並且與致癌作用無關。這對於評估胎兒和性腺組織特別重要。

在大多數中心，肌肉骨骼超音波比CT或MRI等更先進的橫截面檢查方法更容易獲得。

肌肉骨骼超音波檢查比CT或MRI便宜。

與MRI或增強CT相比，肌肉骨骼超音波的禁忌症很少（如果有的話）。

肌肉骨骼超音波成像的實時性對於評估生理以及解剖結構（例如胎兒心率）很有用。

對器官和血管的多普勒評估增加了生理數據的維度，這是其他方式（某些MRI序列除外）無法獲得的。

與CT或MRI相比，肌肉骨骼超音波圖像可能不會受到金屬物體的不利影響。

肌肉骨骼超音波檢查可以輕鬆擴展到另一個器官系統或評估對側肢體。

大腸鏡檢查缺點

需要進行培訓才能準確有效地進行肌肉骨骼超音波檢查，並且檢查質量不均勻（“操作者依賴性”）。

肌肉骨骼超音波波無法評估具有高聲阻抗（例如骨骼，空氣）的組織類型的內部結構。在評估骨骼中包裹的結構（例如顱骨內部的腦實質）時，它也受到限制。

肌肉骨骼超音波波的高頻率會在微觀水平上造成熱加熱或對組織造成機械損傷的潛在風險。這是胎兒成像中最令人關注的問題。

肌肉骨骼超音波具有自己的一套獨特的偽影（美國偽影），這可能會降低圖像質量或導致誤解。

一些肌肉骨骼超音波檢查可能會受到異常大體型習慣的限制。